Девочка-волшебница Мадока★Волшебный фильм 3: История восстания

История продолжает события предыдущей части. Любящая семья, надёжные друзья, радость и печаль, смех и слёзы — это то, что делает жизнь четырнадцатилетней Мадоки Канамэ, ученицы второго класса средней школы города Митакихара, такой, какую люди называют обычной и ничем не выделяющейся. Но всё меняется, когда однажды ночью Мадока видит странный сон о таинственной темноволосой девочке, сражающейся против ужасного кошмара в мире, совершенно нереальном и невозможном на первый взгляд. На следующее же утро Мадока узнаёт о том, что к ней в класс переводится девочка по имени Хомура Акэми, чью необычную схватку она и наблюдала ночью. Их встреча приведёт к инциденту, который навсегда изменит судьбу Мадоки.